| 1 | Swedbank Spordiklubi | 80005023 | Harjumaa | Tallinn |
| 2 | Jalgpalliklubi FC Mulgi | 80009379 | Viljandimaa | Mulgi |
| 3 | Spordiklubi 10 | 80012141 | Tartumaa | Tartu linn |
| 4 | Kohtla-järve Jalgpalliklubi FC Lootus Jalgpallikool Järve MTÜ | 80016009 | Ida-Virumaa | Kohtla-Järve |
| 5 | Kohtla-Järve FC Järve | 80029957 | Ida-Virumaa | Kohtla-Järve |
| 6 | Jalgpalliklubi FS Junior | 80031368 | Harjumaa | Maardu |
| 7 | Koeru Spordiklubi | 80031471 | Järvamaa | Järva |
| 8 | Jalgpalliklubi Tribling | 80035107 | Raplamaa | Kehtna |
| 9 | MTÜ Jalgpalliklubi Dünamo | 80040143 | Harjumaa | Tallinn |
| 10 | MTÜ Nõmme Kalju FC | 80048819 | Harjumaa | Tallinn |
| 11 | MTÜ Jõgeva Spordiklubi Noorus-96 | 80051164 | Jõgevamaa | Jõgeva |
| 12 | Jalgpalliklubi FCF | 80052376 | Harjumaa | Tallinn |
| 13 | Jalgpalliklubi FC Kuressaare | 80052525 | Saaremaa | Saaremaa |
| 14 | Fci Levadia MTÜ | 80053192 | Harjumaa | Tallinn |
| 15 | Jalgpalliklubi FC Valga Warrior | 80053737 | Valgamaa | Valga |
| 16 | Jalgpalliklubi FC Reaal | 80056894 | Harjumaa | Tallinn |
| 17 | Jalgpalliklubi FCF Jalgpallikool | 80059220 | Harjumaa | Tallinn |
| 18 | Saue Jalgpalliklubi | 80059728 | Harjumaa | Saue |
| 19 | MTÜ FC Viljandi | 80060105 | Viljandimaa | Viljandi linn |
| 20 | Jalgpalliklubi Narva Trans | 80069833 | Ida-Virumaa | Narva |
| 21 | Tartu Jalgpalliklubi | 80072433 | Tartumaa | Tartu linn |
| 22 | Spordiklubi Kärla | 80073852 | Saaremaa | Saaremaa |
| 23 | Järvamaa Jalgpalliklubi | 80074745 | Järvamaa | Paide |
| 24 | Rapla Jalgpalliklubi Atli | 80091927 | Raplamaa | Rapla |
| 25 | Jalgpalliklubi "Merkuur-Juunior" | 80093151 | Tartumaa | Tartu linn |
| 26 | Spordiklubi SK Spartak | 80097261 | Harjumaa | Tallinn |
| 27 | Taebla Valla Spordiklubi | 80100848 | Läänemaa | Lääne-Nigula |
| 28 | Spordiklubi Risti | 80102677 | Läänemaa | Lääne-Nigula |
| 29 | Jalgpalliklubi Puuma | 80106095 | Harjumaa | Tallinn |
| 30 | Märjamaa Spordiklubi | 80107551 | Raplamaa | Märjamaa |
| 31 | Adavere Spordiklubi | 80112670 | Jõgevamaa | Põltsamaa |
| 32 | Narva Spordiklubi Baltika | 80121350 | Ida-Virumaa | Narva |
| 33 | MTÜ FC Lelle | 80127571 | Raplamaa | Kehtna |
| 34 | Spordiklubi Real | 80130395 | Harjumaa | Tallinn |
| 35 | MTÜ Spordiklubi Mercury | 80130946 | Harjumaa | Tallinn |
| 36 | Jalgpalliklubi Olympic | 80133896 | Harjumaa | Tallinn |
| 37 | Emmaste Spordiklubi | 80135524 | Harjumaa | Kiili |
| 38 | Spordiklubi Etland | 80150446 | Harjumaa | Tallinn |
| 39 | MTÜ Jalgpallihaigla | 80150771 | Harjumaa | Tallinn |
| 40 | MTÜ FC Ajax-Tallinn | 80151380 | Harjumaa | Tallinn |
| 41 | MTÜ Kotka Staadion | 80154869 | Harjumaa | Tallinn |
| 42 | Tõrva Jalgpalliklubi | 80155413 | Valgamaa | Tõrva |
| 43 | Jalgpalliklubi Võru | 80155656 | Võrumaa | Võru linn |
| 44 | Sõrve Jalgpalliklubi | 80159401 | Saaremaa | Saaremaa |
| 45 | Põhja-Tallinna Jalgpalliklubi | 80160093 | Harjumaa | Tallinn |
| 46 | Jalgpalliklubi Püsivus Kohila | 80160189 | Raplamaa | Kohila |
| 47 | Eesti Leegionäride Jalgpalliklubi | 80160195 | Harjumaa | Tallinn |
| 48 | Jalgpalliklubi FC Toompea | 80160522 | Harjumaa | Tallinn |
| 49 | Infonet FC MTÜ | 80163199 | Harjumaa | Tallinn |
| 50 | MTÜ Eesti Rannajalgpalli Liit | 80171939 | Harjumaa | Viimsi |
| 51 | Jalgpalliklubi Tallinna Kalev | 80176115 | Harjumaa | Tallinn |
| 52 | FC Velldoris | 80199688 | Harjumaa | Tallinn |
| 53 | MTÜ FC Kose | 80213230 | Harjumaa | Kose |
| 54 | Türi Ganvix Jalgpalliklubi | 80213945 | Järvamaa | Türi |
| 55 | MTÜ Litsentseeritud Jalgpallitreenerite Ühendus | 80231245 | Harjumaa | Tallinn |
| 56 | Lõuna-Läänemaa Jalgpalliklubi | 80267421 | Pärnumaa | Lääneranna |
| 57 | Saaremaa Jalgpalliklubi | 80271411 | Saaremaa | Saaremaa |
| 58 | Jalgpalliklubi FC Ararat | 80302287 | Harjumaa | Tallinn |
| 59 | Jalgpalliklubi Tsempion | 80309800 | Lääne-Virumaa | Rakvere linn |
| 60 | Pärnu Jalgpalliklubide Liit | 80327838 | Pärnumaa | Pärnu |
| 61 | Saaremaa Jalgpalli Liit | 80329553 | Saaremaa | Saaremaa |
| 62 | Jalgpalliklubi Paide Linnameeskond | 80339528 | Järvamaa | Paide |
| 63 | Sillamäe Jalgpalliklubi Dina | 80343725 | Ida-Virumaa | Sillamäe |
| 64 | MTÜ Hiiumaa Jalgpall | 80344437 | Hiiumaa | Hiiumaa |
| 65 | MTÜ JK Pärnu Poseidon | 80355065 | Pärnumaa | Pärnu |
| 66 | MTÜ SK Zenit | 80355177 | Ida-Virumaa | Kohtla-Järve |
| 67 | MTÜ Viimsi JK | 80365313 | Harjumaa | Viimsi |
| 68 | MTÜ Maardu LM | 80366169 | Harjumaa | Maardu |
| 69 | MTÜ JK Rada | 80366620 | Harjumaa | Loksa |
| 70 | MTÜ Kohila Jalgpallikool | 80409542 | Raplamaa | Kohila |
| 71 | Jalgpalliklubi FC Valga | 80414603 | Valgamaa | Valga |
| 72 | MTÜ Jalgpallikool FC Tallinn | 80427675 | Harjumaa | Tallinn |