| 1 | Swedbank Spordiklubi | 80005023 | Harjumaa | Tallinn |
| 2 | Jalgpalliklubi FC Mulgi | 80009379 | Viljandimaa | Mulgi |
| 3 | Spordiklubi 10 | 80012141 | Tartumaa | Tartu linn |
| 4 | Kohtla-järve Jalgpalliklubi Fc Lootus Jalgpallikool Järve MTÜ | 80016009 | Ida-Virumaa | Kohtla-Järve |
| 5 | Kohtla-Järve FC Järve | 80029957 | Ida-Virumaa | Kohtla-Järve |
| 6 | Jalgpalliklubi FS Junior | 80031368 | Harjumaa | Maardu |
| 7 | Koeru Spordiklubi | 80031471 | Järvamaa | Järva |
| 8 | Jalgpalliklubi Tribling | 80035107 | Raplamaa | Kehtna |
| 9 | MTÜ Jalgpalliklubi Dünamo | 80040143 | Harjumaa | Tallinn |
| 10 | Jalgpalliklubi Piraaja | 80044572 | Harjumaa | Tallinn |
| 11 | Tabasalu Palliklubi | 80044905 | Harjumaa | Harku |
| 12 | MTÜ Nõmme Kalju FC | 80048819 | Harjumaa | Tallinn |
| 13 | MTÜ Jõgeva Spordiklubi Noorus-96 | 80051164 | Jõgevamaa | Jõgeva |
| 14 | Jalgpalliklubi FCF Haapsalu Jalgpallikool | 80052169 | Läänemaa | Haapsalu |
| 15 | Jalgpalliklubi FCF | 80052376 | Harjumaa | Tallinn |
| 16 | Jalgpalliklubi FC Kuressaare | 80052525 | Saaremaa | Saaremaa |
| 17 | Hiiumaa Ühendatud Jalgpalliklubi | 80052755 | Harjumaa | Tallinn |
| 18 | Fci Levadia MTÜ | 80053192 | Harjumaa | Tallinn |
| 19 | Jalgpalliklubi FC Valga Warrior | 80053737 | Valgamaa | Valga |
| 20 | Jalgpalliklubi FC Reaal | 80056894 | Harjumaa | Tallinn |
| 21 | Jalgpalliklubi FCF Jalgpallikool | 80059220 | Harjumaa | Tallinn |
| 22 | Saue Jalgpalliklubi | 80059728 | Harjumaa | Saue |
| 23 | MTÜ FC Viljandi | 80060105 | Viljandimaa | Viljandi linn |
| 24 | Jalgpalliklubi Irbis | 80061317 | Ida-Virumaa | Lüganuse |
| 25 | Jalgpalliklubi FC Kotkas | 80063629 | Harjumaa | Rae |
| 26 | Jalgpalliklubi FLO | 80064942 | Harjumaa | Tallinn |
| 27 | Jalgpalliklubi Narva Trans | 80069833 | Ida-Virumaa | Narva |
| 28 | MTÜ Rakvere JK Tarvas | 80070598 | Lääne-Virumaa | Rakvere linn |
| 29 | Tartu Jalgpalliklubi | 80072433 | Tartumaa | Tartu linn |
| 30 | Spordiklubi Kärla | 80073852 | Saaremaa | Saaremaa |
| 31 | Järvamaa Jalgpalliklubi | 80074745 | Järvamaa | Paide |
| 32 | Jalgpalliklubi FC Tarvastu | 80090709 | Viljandimaa | Viljandi vald |
| 33 | Rapla Jalgpalliklubi Atli | 80091927 | Raplamaa | Rapla |
| 34 | Jalgpalliklubi "Merkuur-Juunior" | 80093151 | Tartumaa | Tartu linn |
| 35 | Jalgpalliklubi Orbiit | 80095517 | Ida-Virumaa | Jõhvi |
| 36 | Spordiklubi SK Spartak | 80097261 | Harjumaa | Tallinn |
| 37 | Taebla Valla Spordiklubi | 80100848 | Läänemaa | Lääne-Nigula |
| 38 | Spordiklubi Risti | 80102677 | Läänemaa | Lääne-Nigula |
| 39 | Jalgpalliklubi Puuma | 80106095 | Harjumaa | Tallinn |
| 40 | Märjamaa Spordiklubi | 80107551 | Raplamaa | Märjamaa |
| 41 | Adavere Spordiklubi | 80112670 | Jõgevamaa | Põltsamaa |
| 42 | Pärnu Pataljoni Jalgpalliklubi | 80116647 | Pärnumaa | Pärnu |
| 43 | Narva Spordiklubi Baltika | 80121350 | Ida-Virumaa | Narva |
| 44 | MTÜ FC Lelle | 80127571 | Raplamaa | Kehtna |
| 45 | Kõrvemaa Jalgpalliklubi | 80127602 | Harjumaa | Tallinn |
| 46 | Spordiklubi Real | 80130395 | Harjumaa | Tallinn |
| 47 | MTÜ Spordiklubi Mercury | 80130946 | Harjumaa | Tallinn |
| 48 | Jalgpalliklubi Olympic | 80133896 | Harjumaa | Tallinn |
| 49 | Jalgpalliklubi FC Elva | 80134163 | Tartumaa | Elva |
| 50 | Emmaste Spordiklubi | 80135524 | Harjumaa | Kiili |
| 51 | MTÜ Keila JK | 80141134 | Harjumaa | Keila |
| 52 | Spordiklubi Etland | 80150446 | Harjumaa | Tallinn |
| 53 | MTÜ Jalgpallihaigla | 80150771 | Harjumaa | Tallinn |
| 54 | MTÜ Kotka Staadion | 80154869 | Harjumaa | Tallinn |
| 55 | Tõrva Jalgpalliklubi | 80155413 | Valgamaa | Tõrva |
| 56 | Jalgpalliklubi Võru | 80155656 | Võrumaa | Võru linn |
| 57 | Mart Poomi Jalgpallikool | 80156182 | Harjumaa | Tallinn |
| 58 | Kärdla Jalgpalliklubi | 80157974 | Hiiumaa | Hiiumaa |
| 59 | Jalgpalliklubi Mustla Tulevik | 80159186 | Viljandimaa | Viljandi linn |
| 60 | MTÜ FC Olimpi | 80159192 | Harjumaa | Tallinn |
| 61 | Viljandi PT Jalgpalliklubi | 80159200 | Viljandimaa | Viljandi linn |
| 62 | Sõrve Jalgpalliklubi | 80159401 | Saaremaa | Saaremaa |
| 63 | Põhja-Tallinna Jalgpalliklubi | 80160093 | Harjumaa | Tallinn |
| 64 | Jalgpalliklubi Püsivus Kohila | 80160189 | Raplamaa | Kohila |
| 65 | Eesti Leegionäride Jalgpalliklubi | 80160195 | Harjumaa | Tallinn |
| 66 | Jalgpalliklubi FC Toompea | 80160522 | Harjumaa | Tallinn |
| 67 | Infonet FC MTÜ | 80163199 | Harjumaa | Tallinn |
| 68 | FC Hiiumaa | 80167211 | Hiiumaa | Hiiumaa |
| 69 | Kuusalu Jalgpalliklubi Rada | 80171253 | Harjumaa | Kuusalu |
| 70 | Jalgpalliklubi Tallinna Kalev | 80176115 | Harjumaa | Tallinn |
| 71 | FC Velldoris | 80199688 | Harjumaa | Tallinn |
| 72 | MTÜ FC Kose | 80213230 | Harjumaa | Kose |
| 73 | Türi Ganvix Jalgpalliklubi | 80213945 | Järvamaa | Türi |
| 74 | MTÜ Litsentseeritud Jalgpallitreenerite Ühendus | 80231245 | Harjumaa | Tallinn |
| 75 | Lõuna-Läänemaa Jalgpalliklubi | 80267421 | Pärnumaa | Lääneranna |
| 76 | Viidumäe Jalgpalliklubi | 80271405 | Saaremaa | Saaremaa |
| 77 | Saaremaa Jalgpalliklubi | 80271411 | Saaremaa | Saaremaa |
| 78 | MTÜ Harju Jalgpallikool | 80296316 | Harjumaa | Saue |
| 79 | Jalgpalliklubi FC Ararat | 80302287 | Harjumaa | Tallinn |
| 80 | Jalgpalliklubi Tsempion | 80309800 | Lääne-Virumaa | Rakvere linn |
| 81 | Läänemaa Jalgpalliklubi | 80310938 | Läänemaa | Haapsalu |
| 82 | MTÜ Jalgpallikool Tammeka | 80315611 | Tartumaa | Tartu linn |
| 83 | MTÜ Jõhvi Jalgpalliklubi FC Phoenix | 80315723 | Ida-Virumaa | Jõhvi |
| 84 | Jalgpalliklubi Puuma Jalgpallikool | 80334117 | Harjumaa | Tallinn |
| 85 | Jalgpalliklubi Paide Linnameeskond | 80339528 | Järvamaa | Paide |
| 86 | MTÜ Raplamaa Jalgpallikool | 80344038 | Raplamaa | Rapla |
| 87 | MTÜ Maardu LM | 80366169 | Harjumaa | Maardu |